- 10 pg의 total RNA로부터 RNA-Seq library 구축
- 약 7.5시간 내에 strand-specific RNA-Seq library 제작 가능
- 최대 16종의 multiplex sequence용 library 제작
제품설명
Ovation Single Cell RNA-Seq System은 불과 10 pg의 total RNA로부터 strand-specific RNA-Seq library를 약 7.5시간만에 제작할 수 있다.
rRNA를 제거하기 위한 특별한 조작없이, 특별하게 제작된 whole transcriptome primer를 사용하여 1st strand cDNA를 합성할 수 있다.
본 제품에는 NGS library 제작에 필요한 필수 시약이 모두 포함되어있어 합성한 cDNA를 곧바로 NGS library로 제작 가능하다.
본 제품은 total RNA로부터 Barcoded library를 32회분 제작 가능하며, 최대 16종류의 바코드 어댑터 (Barcode adaptor)를
이용하여 Multiplex sequencing이 가능하다.
그림 1. Single Cell RNA-Seq Workflow
그림 2. 5’ to 3’ Transcript Read Coverage
Graphical representation of the 5’-3’ distribution across all RefSeq genes greater than 500 bp in length of two libraries prepared with
10 pg of MAQC A (UHR) and MAQC B (brain) total RNA using the Ovation Single Cell RNA-Seq Library System. The X-axis represents the distance
of the transcript from 5’ to 3’ end normalized to 100% for graphical purposes; and the Y-axis indicates the normalized coverage for
each region of the transcript. Each library was sequenced on one lane of the Illumina Genome Analyzer IIx (single read sequencing,
40 bp read), generating 28.1 X 106 and 32.8 X 106 reads for UHR and brain respectively.
내용
Ovation Single Cell RNA-Seq System (Code 0342-32)
- MgCl2 Solution
- First Strand Primer Mix
- First Strand Buffer Mix
- First Strand Enzyme Mix
- cDNA Processing Enzyme I
- cDNA Processing Enzyme II
- cDNA Processing Reagent I
- cDNA Processing Reagent II
- Second Strand Buffer Mix
- Second Strand Primer Mix
- Second Strand Enzyme Mix
- End Repair Enzyme Mix
- Ligation Buffer Mix
- Ligation Enzyme Mix
- Amplification Buffer Mix
- Amplification Enzyme Mix
- Amplification Primer Mix I
- Amplification Primer Mix II
- Ligation Adaptor Mix (16종류)
- Nuclease-free Water
- Agencourt RNAClean XP Beads
보존
Agencourt RNA CleanXP Beads: 4 ℃
그 외의 시약: -20 ℃
Kit 이외에 필요한 시약
- Ethanol(Sigma-Aldrich, Cat.#E7023), for purification steps
- dsDNA HS Assay Kit (Life Tehchnologies)
- Agilent High Sensitivity DNA Kit (Agilent, Cat#5067-4626)
- Qubit 등의 핵산 정량 장치
- Agilent 2100 bioanalyzer등 핵산 분석 장치 및 검출 시약
- Agencourt SPRIStand등의 마그넷 스탠드
- PCR 기기
*Ovation은 NuGEN Technologies사의 등록 상표입니다.
