제품 설명
ExiLERATE LNA qPCR custom primers는 Exiqon 홈페이지의 “Custom LNA qPCR Assay design tool”을 이용하여 lncRNA, mRNA Real Time PCR primer set를 디자인 및 제작하는 제품이다. Primer design tool은 mRNA, non-coding RNA 등 50 ~ 10,000 염기의 RNA에 대해서 최적화되어 있다. (50 base 이하의 small RNA의 경우 Custom microRNA LNA PCR primer sets (Code 206999)를 권장)
ExiLERATE LNA qPCR primers에는 Exiqon 특허의 LNA (Locked Nucleic Acid)가 포함되어있으며, 이는 일반적인 DNA primer에 비하여 다음과 같은 이점을 가지고 있다.
- 매우 높은 서열 특이성 (Specificity) 과 결합력 (Affinity) 보유
- 한 개의 LNA base를 삽입 시마다 2~8℃ Tm값 상승
- 높은 Tm값을 가지는 짧은 길이의 primer를 합성 가능하므로, 분해된 샘플, 고차구조, 소량의 샘플일 경우 검출 유리
- Primer의 Tm값을 정확하게 조절 가능
ExiLERATE LNA qPCR primers의 Tm값은 ExiLERATE LNA qPCR cDNA synthesis kit과 SYBR green master mix에 최적화되어있으며 10ul 반응으로 200회용, 500회용으로 제품을 구비하고 있다.
Primer design tool
프라이머 디자인툴인 Custom LNA qPCR Assay design tool은 Species와 RNA Sequence, Accession No. 또는 키워드를 입력하여 사용한다.
디자인은 수분 내에 완료되며 디자인 결과를 도식화하여 나타낸다 (그림 1). 또한, 디자인툴은 인트론 표기 또는 sequence 변이 (SNPs) 등이
자동적으로 표기 등 여러가지 편리한 기능을 보유하고 있어, Primer design 범위 및 위치를 지정하거나 인트론, SNP의 표시를 변경하여 제작 가능하다.
또한 본 디자인 툴은 Target RNA sequence에 작용하는 microRNA 관련 제품도 나타낸다 (그림 2).
그림 1. 디자인 결과 화면
프라이머 디자인 결과를 도식화하여 나타내며, 프라이머 디자인 위치, 서열 등의 상세정보를 쉽게 확인할 수 있고 인트론이나 SNP 위치 등도 표시하여 나타낸다.
그림 2. Target mRNA, lncRNA와 관련있는 microRNA 정보 표기
목적하는 RNA와 관련있는 microRNA의 정보를 확인 가능하며, 해당 microRNA를 검출하는 qPCR primer, inhibitor, in situ hybridization detection probe 등의 다양한 정보를 확인 가능하다.
구성품
Custom ExiLERATE LNA qPCR Primers 10μ l반응 200회/500회
보존 -20℃
