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Single cell seq 가이드

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Single cell-seq

단일세포 (Single cell) 분석은 세포의 군집 (cell population)이 아닌 세포 하나 하나를 연구하는 방법으로써, 세포 각각의 고유한 생물학적 특성을 규명할 수 있다. 이는 줄기세포, 순환종양세포 (Circulating Tumor Cells; CTC), 조직생검 (tissue biopsy)과 같은 양이 아주 적고 귀중한 샘플을 분석하는 데 매우 중요하다.
Single cell을 보다 민감하고 재현성 높게 분석하기 위한 ‘SMART’한 ‘SMARTer 제품 시리즈’를 소개한다.

Single cell 분석 분야

Single cell은 유전체학 (Genomics), 전사체학 (Transcriptomics), 단백질체학 (Proteomics)과 같이 다양한 학문에서 분석 · 적용될 수 있다. 특히, DNA 수준을 연구하는 유전체학과 RNA 수준을 연구하는 전사체학은 최신의 서열분석기법인 NGS (Next Generation Sequencing) 방법을 주로 이용하고 있으며, 이는 ‘Single cell-seq’으로 통용된다.



Single cell-seq 실험 과정

Single cell 유전체를 분석하기 위한 실험은 일반적으로 ‘Single cell 분리 -> 유전물질의 증폭 -> NGS Library Preparation -> Sequencing’ 순서로 진행된다.
세포 하나에서 NGS 분석에 충분한 양을 얻기 위한 Amplification 과정은 RNA일 경우 Whole Transcriptome Amplification (WTA), DNA일 경우 Whole Genome Amplification (WGA)이라는 특수한 증폭 기술을 사용한다.



Single cell-seq Portfolio

다카라코리아는 Single cell 분리부터 DNA · RNA Amplification, NGS Library Preparation (for Illumina® platform)까지 가능한 제품을 제공하고 있다. That’s Good Science!
* 제품명을 클릭하시면 보다 상세한 제품정보를 확인할 수 있습니다.

· 단일세포 분리 (Single cell sorting / isolation)

High-throughput single cell isolation, selection, and processing
ICELL8® cx Single-Cell System (Code 640189)

  • 한번에 최대 1,200 ~ 1,500개 live single cell 분리
  • 세포 크기에 상관없이 분리 가능 (5 - 100 ㎛)
  • Imaging station을 이용하여 ‘살아있는 single cell’만 선택하여 분석
  • Single cell (단일세포) 분리에서 ‘살아있는 single cell’ 판정까지 단 30분 소요!
  • 적용실험: Differential expression (DE), TCR profiling, RNA-seq, ATAC-seq



· DNA 분석 (Single cell WGA & DNA-Seq)

Gold standard WGA, PicoPLEX 기술을 접목한 Single Cell NGS Library Prep
PicoPLEX® Gold Single Cell DNA-seq Kit

  • Whole Genome Amplification (WGA)을 이용하여 Single cell DNA 분석 (6 pg of DNA 분석가능)
  • Single cell CNV, SNV, Aneuploidy 검출에 탁월
  • 체외수정란의 착상전유전자검사 (PGS/PGD)에서 가장 잘 알려진 분석 기술



· RNA 분석 (Single cell WTA & RNA-Seq)

Single cell 전용 SMART-Seq®



Ultra low input을 위한 SMART-Seq® v4 시리즈

  • Ultra low input (10 pg - 10 ng) 으로부터 Full-length cDNA 합성 및 증폭; Whole Transcriptome 분석
  • Single cell, Ultra-low input (10 pg) RNA 분석의 기준
  • 수많은 논문과 연구자가 인정하는 강력한 Single cell 분석 툴



Single cell-seq 최신 정보 자료