ThruPLEX¢ç Tag-seq KitÀ» ÀÌ¿ëÇÏ¿©
Cell-free DNA·ÎºÎÅÍ Low frequency variants °ËÃâ°ú ºÐ¼®
- µ¥ÀÌÅÍ Á¦°ø: ´ÙÄ«¶ó¹ÙÀÌ¿À
¡ß Introduction
¾Ï ¿¬±¸¿¡¼ Cell-free DNAÀÇ Àúºóµµ º¯ÀÌ (Low frequency variants)¸¦ Á¤È®ÇÏ°Ô °ËÃâÇÏ´Â °ÍÀº ¸Å¿ì Áß¿äÇÏ´Ù. ƯÈ÷, Â÷¼¼´ë ½ÃÄö¼¸¦ ÀÌ¿ëÇÏ¿© ºÐ¼®ÇÏ´Â °æ¿ì NGS Library Preparation °úÁ¤ ÁßÀÇ ÁõÆø ¿¡·¯³ª
½ÃÄö½º ¿¡·¯°¡ ¹ß»ýÇÒ °¡´É¼ºÀÌ ÀÖ¾î »ùÇà ÀÚüÀÇ Àúºóµµ º¯ÀÌ¿Í ±¸º°Çϱ⠾î·Á¿î °æ¿ì°¡ ÀÖ´Ù. ThruPLEX
¢ç Tag-seq Kit´Â 1,600¸¸°³ÀÇ Unique Molecular Tags (UMT)¸¦ ä¿ëÇÑ
NGS Library Preparation Kit·Î½á, UMT¸¦ ÀÌ¿ëÇÏ¿© false-positive variant calls¸¦ ÁÙÀÏ ¼ö ÀÖ¾î º¸´Ù Àúºóµµ·Î Á¸ÀçÇÏ´Â º¯À̸¦ º¸´Ù Á¤È®ÇÏ°Ô °ËÃâÇÒ ¼ö ÀÖ´Ù. º» ÀÚ·á´Â ThruPLEX
¢ç Tag-seq KitÀ»
ÀÌ¿ëÇÏ¿© NGS Library¸¦ Á¦Á¶ÇÑ ÈÄ, Target enrichment¿¡ xGen Lockdown Probes (IDT)¿Í B»çÀÇ Á¦Ç°À» ÀÌ¿ëÇÏ¿© ºÐ¼®ÇÑ µ¥ÀÌÅÍÀÌ´Ù.
¡ß »ç¿ëÁ¦Ç°
ThruPLEX¢ç Tag-seq Kit (Takara)
¡ß Workflow
¡ß º¯ÀÌ À¯ÀüÀÚ °ËÃâ °á°ú

ThruPLEX
¢ç Tag-seq Kit°ú µÎ Á¾·ùÀÇ Target Enrichment KitÀ» ÀÌ¿ëÇÏ¿© º¯ÀÌÀ¯ÀüÀÚ¸¦ °ËÃâÇÑ °á°ú, 1% Multiplex I cfDNA´Â µÎ ½ÇÇ豺¿¡¼ ¸ðµÎ 8Á¾ÀÇ º¯ÀÌ À¯ÀüÀÚ¸¦ °ËÃâÇÒ ¼ö ÀÖ¾ú´Ù.
ÇÑÆí, 0.1% Multiplex I cfDNA¿¡¼´Â IDT Á¦Ç°À» ÀÌ¿ëÇÑ °æ¿ì¿¡ 6Á¾, B ȸ»ç¸¦ ÀÌ¿ëÇÑ °æ¿ì¿¡ 5Á¾ÀÇ º¯ÀÌ À¯ÀüÀÚ¸¦ °ËÃâÇÒ ¼ö ÀÖ¾ú´Ù. µû¶ó¼, Unique Molecular Tags¸¦ žÀçÇÑ ThruPLEX
¢ç Tag-seq Kit°ú
IDT Target Enrichment¸¦ Á¶ÇÕÇÏ¸é º¸´Ù ³·Àº allele frequency¸¦ Á¤È®ÇÏ°Ô °ËÃâÇÒ ¼ö ÀÖ´Ù.
¡ß Ÿ°Ù ¿µ¿ªÀÇ Coverage ºñ±³
¡Ø IDT, Bȸ»çÀÇ Á¦Ç°¿¡¼ °øÅëµÇ´Â Ÿ°ÙÀ¯ÀüÀÚ (30 kb) µ¥ÀÌÅ͸¸ ºñ±³

ThruPLEX
¢ç Tag-seq Kit¿Í IDT Target Enrichment KitÀ» Á¶ÇÕÇÑ °æ¿ì, º¸´Ù ³ôÀº coverage rate¸¦ º¸¿´À¸¸ç, low frequency variant °ËÃâ¿¡ µÎ Á¦Ç°ÀÇ Á¶ÇÕÀÌ ÀûÇÕÇÔÀ» ¾Ë ¼ö ÀÖ¾ú´Ù.