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Home > 전제품보기 > NGS 관련 > 기타 NGS Library Kit > SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit
TCR α/β V(D)J 가변영역의 Full-length sequence 가능

SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit

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제조사 제품코드 제품명 용량 가격
(부가세별도)
비고 사용자매뉴얼
Clontech
635014
SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit
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12회
1,406,400원 
1,758,000원
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114424
Clontech
635015
SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit
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48 회
4,500,000원 
5,625,000원
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04.17 ~ 05.31
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Clontech
635016
SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit
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96 회
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  • TCR-alpha, TCR-beta chain을 동시에 또는 개별적으로 NGS Library 제작 가능
  • Complete V(D)J sequence information: T-cell receptor (TCR)의 V(D)J 가변영역 (V(D)J variable region의 Full-length sequencing
  • Flexible sample inputs: 소량의 Human blood RNA sample (10ng - 3ug) 또는 intact lymphocytes (50 - 10,000 purified T cells)에서 NGS Library를 제작 가능
  • Illumina-ready sequencing libraries: ligation-independent 방식으로 illumine adaptor 및 index sequence 부착 가능
  • Exceptional sensitivity, and excellent reproducibility
제품설명
SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit은 T-cell receptor (TCR) repertoire의 NGS 분석을 위한 Illumina platform NGS Library 제작 키트이다. 본 제품은 미량의 Human blood RNA sample (10ng - 3ug), 또는 intact lymphocytes (50 - 10,000 purified T cells)로부터 TCR 전사체의 V(D)J 가변영역 (variable region) 분석을 위하여 5’ RACE 유사 기술을 접목하였으며, TCR mRNA의 Full length sequence를 분석할 수 있다. 본 제품을 이용하면 TCR-α, TCR-β chain을 동시에 또는 chain에 대한 라이브러리를 제작하여 분석할 수 있다.
Multiplexing PCR을 이용하는 기존의 TCR profiling 방법과 달리, 본 제품은 각각의 TCR-α와 TCR-β chain에 대한 single primer를 사용하는 2단계의 PCR 방법으로 Illumina용 라이브러리를 증폭한다.
본 제품은 LNA 기술이 결합된 SMART (Switching Mechanism at 5’ End of RNA Template)법을 이용하므로 민감도가 매우 높고 편향성이 적은 TCR mRNA sequence 분석을 할 수 있다.


그림 1. Protocol overview and timeline




그림 2. SMARTer TCR profiling 기술의 Library 제작 과정 및 원리
Panel A. TCR subunit mRNA의 역전사반응과 PCR 증폭 과정
Panel B. TCR-α, TCR-β chain의 증폭을 위한 semi-nested PCR


그림 3. TCR sequencing library의 Electropherogram profiles
Panel A. Typical Fragment Analyzer profile of sequencing library for TCR-α and TCR-β, obtained from peripheral blood leukocyte RNA Panel B. Typical Bioanalyzer profile of sequencing library for TCR-α and TCR-β, obtained from peripheral blood leukocyte RNA (same library as Panel A) Panel C. Typical Fragment Analyzer profile of sequencing library for TCR-α and TCR-β, obtained from monoclonal Jurkat T-cell RNA. Panel D. Typical Bioanalyzer profile of sequencing library for TCR-α and TCR-β, obtained from Jurkat T-cell RNA (same library as Panel C)
Application
Human TCR repertoire analysis (TCR-alpha and TCR-beta subunits)
구성품 (자세한 내용은 CoA를 참조하세요)
SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit (Code 635014)
  • SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit Components (Cat. No. 635017; Not sold separately)
  • TCR a/b Human Indexing Primer Set HT for Illumina - 12 (Cat. No. 635020; Not sold separately)
  • SeqAmp DNA Polymerase (Cat. No. 638504)

Keyword : TCR,T cell receptor,V(D)J,SMARTer,NGS,SMART
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