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Home > 전제품보기 > NGS 관련 > mRNA-Seq (Single cell) > Single cell RNA-seq에 최적인 SMART-Seq® Single Cell Kit
최고의 감도 및 성능으로 single cell NGS 분석

Single cell RNA-seq에 최적인 SMART-Seq® Single Cell Kit

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제조사 제품코드 제품명 용량 가격
(부가세별도)
비고 사용자매뉴얼
Clontech
634470
SMART-Seq® Single Cell Kit
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12 회
2,018,000원  제조사 페이지로 바로가기 SMART-Seq%20Single%20Cell%20Kit%20User%20Manual_101619.pdf
Clontech
634471
SMART-Seq® Single Cell Kit
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48 회
5,581,000원  제조사 페이지로 바로가기
Clontech
634472
SMART-Seq® Single Cell Kit
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96 회
10,044,000원  제조사 페이지로 바로가기
Clontech
634473
SMART-Seq® Single Cell Kit
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480 회
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* 480회 용량의 SMART-Seq® Single Cell Kit (Code 634473)의 구매를 원하시는 분은 다카라코리아 고객지원센터 (Tel. 02-2081-2510)로 연락 바랍니다.

  • Easy, plate-based workflow - FACS 등으로 분리한 single cell에 바로 적용 가능
  • Unparalleled sensitivity and reproducibility - 높은 유전자 검출 효율을 이용한 최고 성능의 단일 세포 RNA-seq (특히, RNA 함량이 매우 낮은 세포 및 핵에 적용)
  • Robust, full-length chemistry - SMART-seq2를 포함한 기존의 모든 single cell full-length 분석법을 뛰어넘는 성능
  • Highly scalable workflow - 대량 (High-throughput) 실험 적용가능, 자동화 기기 적용에 최적
제품설명
SMART-Seq® Single Cell Kit는 single cell 혹은 single nuclei RNA-Seq을 위한 제품으로, 고감도 cDNA를 재현성 높게 제작할 수 있다. Single cell에서 RNA를 추출하지 않고도, 바로 고품질 full-length cDNA를 제조할 수 있으며, 여기서 얻은 cDNA는 lllumina® 플랫폼의 라이브러리 제작에 적용할 수 있다. 본 제품은 single cell 분석을 위해 SMART-Seq® 기술을 개량하여 개발되었으며, SMART-Seq2 등 기존의 방법 및 당사 기존 제품 (SMART-Seq® v4)에 비해 훨씬 우수하게 single cell로부터 RNA-Seq을 위한 라이브러리 제작이 가능하다. 본 제품을 이용하여 2 pg total RNA와 RNA 함량이 낮은 것으로 알려져 있는 말초혈액 단핵세포 (PBMCs)와 같은 single cell에서 우수한 결과를 확인하였다.


그림 1. SMART-Seq® Single Cell Kit와 SMART-Seq2 법과의 결과 비교
SMART-Seq2을 이용했을 때 보다 SMART-Seq® Single Cell Kit을 이용했을 때, mitochondria 유래 유전자로부터 훨씬 더 높은 mapped reads와 보다 많은 유전자가 검출됨을 확인하였다.

Single cells from the lymphoblastoid cell line GM12878 were processed with the SMART-Seq Single Cell Kit (SSsc; 18 cells) or the Smart-seq2 method (Smart-seq2; 20 cells) using 19 cycles of PCR. RNA-seq libraries were generated and sequences analyzed (after normalizing all samples to 1.75 million paired-end reads). Panel A. The read distribution was different between the two chemistries, with a drastically higher number of reads mapping to the mitochondrial genome (and therefore, fewer reads available for gene identification) with Smart-seq2 chemistry. Panel B. More genes were detected in the cells processed with SSsc.


그림 2. SMART-Seq® Single Cell Kit와 당사 기존 제품인 SMART-Seq v4와의 비교
당사 기존 제품인 SMART-Seq v4을 이용했을 때 보다 SMART-Seq® Single Cell Kit을 이용했을 때,
더 높은 cDNA yield를 얻었고, reads에 관계없이 검출되는 유전자 수가 60% 이상임을 확인하였다.

12 single cells from lymphoblastoid cell line GM22601 were processed with SSv4 or SSsc using 19 cycles of PCR. All samples were normalized to 1.25 million paired-end reads. The cDNA yield generated with SSsc was drastically higher than that generated with SSv4. Panel B. About 50 single PBMCs from one donor were processed with SSv4 or SSsc. About 60% more genes were detected in the cells processed with SSsc, regardless of the number of reads used for the analysis.
적용
Single cell 유래 full-length transcriptome 분석을 위해, cDNA 합성 과정에서 사용할 수 있다. 본 제품을 이용해 합성한 cDNA는 Nextera XT DNA Library Preparation Kit (Illumina® Cat. No. FC-131-1024, FC-131-1096) 를 이용하여 Illumina® sequencing library로 제작할 수 있다.
자세한 구성은 CoA를 참고하세요.






Keyword : Single cell,Low input,ultra low input,Illumina,NGS,next generation sequencing,cDNA,RNA-seq,cDNA-seq,SSsc
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