RNA-Seq 제품명이 이렇게 바뀝니다
기존 RNA-Seq kit의 제품명이 새롭게 변경될 예정이니 아래 내용을 참고 바랍니다.
(카테고리를 클릭하시면 해당 부분으로 이동합니다)
기존의 길고 복잡한 제품명 때문에 제품 선택에 어려움이 있었다면,
| 기존 kit 제품명 예시 |
|
SMART-Seq v4 Ultra low input RNA kit for Sequencing |
NGS kit의 새 이름에 제품사양이 명시되어 NGS kit 선택이 보다 더 쉬워집니다.
【 New naming 방법 】
다카라의 SMART 기술은 single cell, 극소량 RNA 샘플 분석의 교과서로 알려져 있습니다. 이 기술을 적용한 RNA-Seq kit는 제품명 맨 앞에 다카라의 브랜드 네임인 SMART-Seq®이 들어갑니다.
>> 독자적인 SMART 기술 보러가기
RNA-Seq을 위한 cDNA 합성 시 사용되는 primer 타입에 따라 2가지로 명시됩니다. Oligo(dT) primer를 사용하는 시스템은 mRNA로, Random primer는 Total RNA로 명시됩니다.
| 기존 이름 | 새 이름 |
| SMART-Seq® Single Cell Kit | SMART-Seq® mRNA Single Cell |
| SMART-Seq® Stranded Kit | SMART-Seq® Total RNA Single Cell |
Library preparation (LP) system이 포함되어 있는 경우에 표기합니다.
RNA-Seq kit는 RNA-Seq을 위해 cDNA까지만 합성할 수 있는 제품과 Illumina용 Library 제작까지 가능한 제품, 총 두가지 형태를 보유하고 있습니다. 기존에는 Library 제작까지 가능한 제품을 PLUS로 표기를 했었으나, 이제는 LP (Library Preparation)로 명시합니다.
RNA-Seq kit는 RNA-Seq을 위해 cDNA까지만 합성할 수 있는 제품과 Illumina용 Library 제작까지 가능한 제품, 총 두가지 형태를 보유하고 있습니다. 기존에는 Library 제작까지 가능한 제품을 PLUS로 표기를 했었으나, 이제는 LP (Library Preparation)로 명시합니다.
| 기존 이름 | 새 이름 |
| SMART-Seq® v4 PLUS Kit | SMART-Seq® mRNA LP |
UMIs (Unique Molecular Identifiers)가 포함된 경우에 제품명 뒤에 ‘(with UMIs)’를 명시합니다. UMIs는 PCR errors, duplicates, amplification biases를 보정하여 신뢰도 있는 결과를 도출하는데 중요한 역할을 합니다. 기존의 제품은 제품명을 보고 UMIs의 포함 유무를 알기 어려웠지만 앞으로는 UMIs가 포함되어 있는 경우, 제품명을 통해 UMIs 포함 유무를 쉽게 알 수 있습니다.
예를 들어, SMARTer® Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian는 UMIs가 포함되어 있으며 ‘(with UMIs)’를 제품명 뒤에 명시합니다.| 기존 이름 | 새 이름 |
| SMARTer® Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian | SMART-Seq® Total RNA-Pico Input (with UMIs) |
【UMIs가 부가된 read 구조】
기존에는 index가 포함된 제품형태와 그렇지 않은 제품이 함께 판매되고 있었습니다.
앞으로는 모든 제품에서 구성품 중 index가 빠지고, Unique dual index (UDI)를 별도 구매하는 시스템으로 변경됩니다 (DNA-Seq 제품은 변경되지 않음).
앞으로 변경되는 모든 품목에는 index가 포함되지 않으며,앞으로는 모든 제품에서 구성품 중 index가 빠지고, Unique dual index (UDI)를 별도 구매하는 시스템으로 변경됩니다 (DNA-Seq 제품은 변경되지 않음).
반드시 아래의 Unique Dual Index (UDI)를 별도로 구입해야 합니다.
| Code | 제품명 | 용량 |
| 634756 | Unique Dual Index Kit (1-24) | 24 x 5 ㎕ |
| 634752 | Unique Dual Index Kit (1-96) | 96 x 5 ㎕ |
| 634753 | Unique Dual Index Kit (97-192) | 96 x 5 ㎕ |
| 634754 | Unique Dual Index Kit (193-288) | 96 x 5 ㎕ |
| 634755 | Unique Dual Index Kit (289-384) | 96 x 5 ㎕ |
기존에는 제품에 따라 판매하는 용량이 달랐습니다.
앞으로는 제품 사이즈를 24회, 96회, 384회 (96회x4)로 통일합니다.
앞으로는 제품 사이즈를 24회, 96회, 384회 (96회x4)로 통일합니다.
기존 이름 |
용량 |
새 이름 |
용량 |
12회 |
24회 |
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48회 |
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12회 |
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12회 |
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12회 |
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48회 |
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12회 |
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48회 |
| [New] 제품명 | Primer type | Library 제작까지 OK | UMIs 포함 |
| SMART- Seq® mRNA | Oligo(dT) primer | － | － |
| SMART-Seq® mRNA LP | Oligo(dT) primer | ○ | － |
| SMART-Seq® mRNA LP (with UMIs) | Oligo(dT) primer | ○ | ○ |
당분간은 기존 제품의 구매가 가능하나 순차적으로 새로운 제품으로 대체될 예정입니다 (2022년 11월 기준).