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Home > 전제품보기 > NGS 관련 > 다양한 input DNA-seq > ThruPLEX® DNA-Seq FLEX
FFPE, cell-free DNA NGS library제작에 최적

ThruPLEX® DNA-Seq FLEX

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제조사 제품코드 제품명 용량 가격
(부가세별도)
비고 사용자매뉴얼
Clontech
R400736
ThruPLEX® DNA-Seq FLEX
관련학술 구매하기 라이선스 
96 회
2,950,000원  제조사 페이지로 바로가기 x108661
Clontech
635101
ThruPLEX® DNA-Seq FLEX EF
관련학술 구매하기 라이선스 
96 회
(Package)
3,637,000원  제조사 페이지로 바로가기 x350163

  • 간편한 single tube workflow로 샘플 loss 방지 및 시간 절약 가능
  • 극소량 (pg수준) fragmented dsDNA만 있으면 Illumina 분석용 NGS library 제작 가능
    - ThruPLEX® DNA-Seq FLEX : 250 pg - 200 ng
    - ThruPLEX® DNA-Seq FLEX EF : 100 pg - 200 ng
  • Input양에 관계없이 재현성이 높고 균일한 커버리지 실현, GC 함량이 높은 영역도 균일한 커버리지 유지
  • 분석이 어려운 FFPE 유래 DNA, cfDNA 등의 분석에 최적
  • Unique Dual Index kit (별도구매)와 같이 사용하면 384 샘플까지 multiplexing 가능
  • DNA 단편화 효소(enzymatic fragmentation)를 포함한 ThruPLEX® DNA-Seq FLEX EF 라인업
제품 설명
ThruPLEX® DNA-Seq FLEX chemistry는 최대 30 ㎕의 input volume을 적용할 수 있으며, single tube에서 약 2시간 만에 간편한 3-step workflow로 반응이 가능하다(그림 1). 중간 정제 단계가 없어 샘플 이동이 필요 없으므로 handling error나 샘플 loss를 방지할 수 있다. ThruPLEX® DNA-Seq FLEX와 Unique Dual Index kit (UDI, 별도구매)를 같이 사용하면, 최대 384개의 샘플을 multiplexing 할 수 있다. 본 시스템을 사용하면 novo sequencing, whole genome resequencing, whole exome sequencing과 다양한 enrichment techniques이 적용된 high-coverage deep sequencing에서 최고의 결과를 얻을 수 있다. Cell-free plasma DNA 혹은 formalin-fixed paraffin embedded (FFPE) 조직에서 추출한 손상된 DNA 등 작은 fragment DNA 분석에 최적인 제품이다.
ThruPLEX® DNA-Seq FLEX EF는 ThruPLEX® DNA-Seq FLEX chemistry에 절편화 기능을 추가한 제품이다. 제품에 포함되어 있는 ThruPLEX® FLEX Enzymatic Fragmentation Module은 ThruPLEX® DNA-Seq FLEX repair 과정에서, 효소를 이용하여 절편화 시키며, 절단되는 절편 크기도 조절할 수 있도록 설계되어 있다. 이를 통해 기계적인 절편화 (mechanical fragmentation) 혹은 별도의 효소를 이용한 절편화 과정을 생략할 수 있다.


그림 1. ThruPLEX® DNA-Seq FLEX를 이용한 single tube, 3-step workflow


그림 2. ThruPLEX® DNA-Seq FLEX 기술
Stem-loop adaptor를 repair 과정에서 blunt된 DNA의 5’ 말단에 ligation 시킨 후, high-fidelity polymerase로 barcode가 포함된 Illumina NGS library를 제작함.

[Input 샘플 정보]

 

ThruPLEX® DNA-Seq FLEX

ThruPLEX® DNA-Seq FLEX EF

Nucleic acid

Fragmented double-stranded DNA or cfDNA

Double-stranded DNA

Source

Cells, plasma, urine, other biofluids, FFPE, tissues, fresh tissues, frozen tissues

Cells, fresh tissues, frozen tissues, microbes

Type

Mechanically sheared; enzymatically fragmented; low-molecular-weight cell-free DNA

제품에 포함된 ThruPLEX® FLEX Enzymatic Fragmentation Module 로 절편화하여 적용

Molecular size

<1,000 bp

Input 양

250 pg - 200 ng

100 pg - 200 ng

Input volume

30 ㎕

Input buffer

≤10 mM Tris, ≤0.1 mM EDTA


[참고]
ThruPLEX FLEX outperforms NEBNext Ultra II for DNA-seq of cell-free and FFPE DNA
(비교 데이터를 확인하려면, 클릭하세요)
자세한 구성은 CoA를 참고하세요.

Keyword :

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