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수식효소/DNA Polymerase、RNA Polymerase
> T4 DNA Polymerase
Cloned
T4 DNA Polymerase
제조사
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제품명
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가격
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비고
사용자매뉴얼
Takara
2040A
T4 DNA Polymerase
100 U
94,000원
Takara
2040B
T4 DNA Polymerase
500 U (2040A x 5)
423,000원
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제품설명
본 효소는 주형 DNA와 primer가 존재할 때 dNTP를 기질로, 주형에 상보적인 DNA를 5’→3’ 방향으로 합성한다. Klenow Fragment에 비하여 약 100~1000배 강한 단일 가닥 DNA에 특이적인 3’→5’ exonuclease 활성이 포함되어 있지만 5’→3’ exonuclease 활성은 없다.
보존
-20℃
농도
5 U/㎕
형상
200 mM
Potassium Phosphate 완충용액 (pH6.5)
1 mM
DTT
50%
Glycerol
첨부 buffer 조성 (10x)
330 mM
Tris-acetate (pH7.9)
660 mM
CH
3
COOK
100 mM
(CH
3
COO)
2
Mg
5 mM
DTT
0.1%
BSA [별첨]
활성의 정의
37℃, pH8.8에서 열 변성 송아지 흉선 DNA를 주형 및 primer로 하여 30 분간 10 nmol의 모든 nucleotide를 산성의 침전물로(acid-insoluble products) 합성하는 효소활성을 1 U으로 한다.
활성 측정용 반응액 조성
67 mM
Tris-HCl (pH8.8)
6.7 mM
MgCl
2
16.6 mM
(NH4)
2
SO
4
1 mM
DTT
6.7 μM
EDTA
0.0167%
BSA
0.2 ㎎/㎖
기질 DNA
각 330 μM
dCTP, dATP, dGTP
330 μM
[
3
H]GTP
사용상의 주의
- 효소 활성을 위해서 Mg
2+
가 필요하고, 최대 활성을 위해서는 SH 환원제를 첨가한다.
- 반응 전체의 이온이 100 mM을 넘을 경우 반응이 저해된다.
- 10x 첨부 buffer에 0.1% BSA를 바로 넣을 경우 대량의 백색 침전이 생기므로 반응액을 조제할 때 다음의 순서로 시약을 첨가한다.
멸균 정제수 → 10x 첨부 buffer → 0.1% BSA → 기질 DNA
용도
- DNA 절편의 평활 말단화
- 3’→5’ exonuclease 활성을 이용한 replacement synthesis에 의한 DNA의 3’-말단 표식
기원
Escherichia coli
carrying the plasmid containing phage T4 DNA polymerase gene
일반적 성질
- 분자량: 약 114,000
- Subunit
단순한 polypeptide
활성에 필수적인 15개의 cysteine기를 가지고 있다.
- 보조인자
Mg
2+
(최적농도: 6 mM), Mn
2+
(최적농도: 0.1 mM, 6 mM Mg
2+
일때 활성의 1/4), SH시약 (2-mercaptoethanol, DTT 등)
- 활성화제: polymerase 활성은 T4 gene 32 산물에 특이적으로 증가하지만, exonuclease 활성은 포화량의 T4 gene 32 산물에 완전히 저해된다.
- 저해제: NEM
- 안정성: vortex 등의 격렬한 교반 시 불활성화 된다.
- 최적 염 농도: 100 mM (너무 높을 경우 반응이 저해된다. 200 mM에서 50mM의 5%의 활성을 보인다.)
- Polymerase 활성과 exonuclease 활성의 관계
다음의 3가지 조건이 갖추어 지면 polymerase 활성을 나타낸다.
1. 주형
2. 주형보다 적어도 1염기 짧은 3’-OH 말단 primer
3. 주형에 상보적인 dNTP
이 중 1가지라도 없으면 exonuclease로 작용한다.
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Keyword :
수식효소/DNA Polymerase、RNA Polymerase
Cloned
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