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Integration Site Analysis Kit

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GenomeWalker를 기반으로 provirus의 게놈 삽입 부위를 식별
MMLV 및 MSCV타입의 retroviral vector에 적용 가능
분석에 필요한 모든 시약 포함

제품설명

Retro-X Integration Site Analysis Kit는 레트로 바이러스 벡터가 host genome DNA에 provirus로 삽입된 부분을 GenomeWalker 기술을 기분으로 분석하기 위한 제품이다. 레트로바이러스는 RNA genome virus로 DNA로 역전사 되어 host genome에 삽입된다. 바이러스 DNA는 host genome에 무작위로 삽입되기 때문에 목적유전자 및 endogenous 유전자 발현에 영향을 줄 수 있다. 따라서 provirus의 삽입부위의 식별은 host cell의 표현형 연구에 중요하다. 이 키트에는 실험에 필요한 모든 시약이 포함되어 있다. (자세한 구성품 리스트는 CoA를 참고)

GenomeWalker 개요

1. 바이러스를 형질 도입한 세포에서 추출한 genomic DNA를 3종류의 blunt-end 제한효소 처리
2. 평활말단이 된 genomic DNA library에 GenomeWalker adaptor를 ligation.
3. Library에서 adaptor와 렌티바이러스 시퀸스가 포함된 부분을 PCR 증폭
4. Nested PCR을 통해 단일밴드 증폭, 증폭 된 산물은 sequencing을 통해서 integration부분 분석, 복수의 단편이 증폭되는 경우에는
각각의 band를 정제 한 후 sequencing을 통해서 분석

그림. Flow chart of the Lenti-X Integration Site Analysis protocol. The major steps include construction of three viral integration libraries, PCR amplification of genomic DNA from the libraries, and analysis of PCR products. The gel shows a typical result. Lane 1: HpaI library. Lane 2: DraI library. Lane 3: SspI library. Lane 4: No template control. Lane M: DNA size markers. AP: Adaptor primer. LSP: Lentivirus-specific primer.

Components & Storage Conditions

각 제품 구성물과 보관조건은 Certificate of Analysis 를 참조하십시오.

Keyword :

Retrovirus

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